
所属学科专业:计算机科学与技术、软件工程
导师简介:
李垚垚,工学博士,女,副研究员,西安工程大学校聘副教授。2020年获西安电子科技大学计算机科学与技术专业工学博士学位。2020年7月至2022年6月就职于浙江天猫技术有限公司,并荣获内部核心创新技术奖等。2022年至2024年于西安电子科技大学杭州研究院从事博士后课题研究,出站后留院工作。2025年12月起担任西安工程大学beat365在线唯一官网校聘副教授。现从事机器学习、计算机视觉、计算生物信息学、癌症基因组数据挖掘、序列预测等研究。近年来主持浙江省自然科学基金项目1项,同时参与了多项国家自然科学基金面上项目、陕西省自然科学基金项目等,在国际知名期刊发表SCI论文多篇。
主要研究方向:
1.机器学习与大数据处理、生物信息计算;
2.医学图像处理、计算机视觉。
主持、参与纵向科研项目
[1]浙江省科学技术厅,浙江省自然科学基金联合基金资助项目, LHZY24F050001,基于动态光学乳腺成像的早期乳腺癌智能辅助筛查研究, 2024-01至2026-12, 10万元,在研,主持。
[2]国家自然科学基金委员会,面上项目, 61974109,集成化高精度脑电信号读取与特征提取技术研究, 2020-01-01至2023-12-31, 59万元,结题,参与。
[3]国家自然科学基金委员会,面上项目,61571341,基于新一代测序数据的肿瘤纯度及倍体动态预测方法研究, 2016-01-01至2019-12-31, 60万元,结题,参与。
[4]西安电子科技大学,研究生创新基金项目,癌基因组中肿瘤克隆异质性与拷贝数变异检测研究, 2019-01-01至2019-12-31,结题,主持。
发表学术论文
[1]Yaoyao Li,Yajie Yan, Xiguo Yuan, COPCNVBD: An Integrated Approach for Copy Number Variation and Breakpoint Detection usingWhole GenomeSequencing Data, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,2025,22(2):867-876.
[2]Yaoyao Li, Yipei Zhang, Qiang Yu, Chenglong He, Xiguo Yuan, Intelligent scoring system based on dynamic optical breast imaging for early detection of breast cancer, Biomedical Optics Express, 2024, 15(3): 1515-1527.
[3]Yaoyao Li, Fangjia Yang, Kun Xie, CNV_MCD: Detection of Copy Number Variations based on Minimum Covariance Determinant using Next-generation Sequencing Data, Digital Signal Processing, 2024,11(154):104680.
[4]Xue Li, Pengyue Liu, Xiguo Yuan, Ruowen Rong,Yaoyao Li, Rong Luan. Bayesian Dynamic Ensemble Selection Method for Dynamic Optical Breast Imaging Classification, 2025, Journal of Intelligent & Fuzzy Systems. (accepted)
[5]Yaoyao Li, Junying Zhang, Xiguo Yuan, BagGMM: calling copy number variation by bagging multiple Gaussian mixture models from tumor and matched normal next-generation sequencing data, Digital Signal Processing, 2019, 88:90-100.
[6]Yaoyao Li, Xiguo Yuan, Junying Zhang, Liying Yang, Jun Bai, Shan Jiang, SM-RCNV: a statistical method to detect recurrent copy number variations in sequenced samples, Genes & Genomics, 2019, 41:529-536.
[7]Yaoyao Li, Junying Zhang, Xiguo Yuan, Junping Li, dpGMM: a Dirichlet process Gaussian Mixture Model for copy number variation detection in low-coverage whole-geneome sequencing data, IEEE Access, 2020, 8:27973-27985.
[8]Xiguo Yuan, Junying Zhang, Bai Jun, JunboDuan,Yaoyao Li, Meihong Gao, CONDEL: detecting copy number variation and genotyping deletion zygosity from single tumor samples using sequence data, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018, 11(26):1-1.
[9]Yajun Liu, Junying Zhang, Aimin Li, Yuanyuan Zhang,Yaoyao Li, Xiguo Yuan, Zongzhen He, Zhaowen Liu, Shouheng Tuo. Identification of PIWI-interacting RNA modules by weighted correlation network analysis. Cluster Computing, 2019, 22: 707-717.
授权发明专利
[1]李垚垚等.专利名称:一种基于对比学习的乳腺肿瘤良恶性分类方法及系统, 2025.08.27,中国, ZL202510976492.6 [P].
[2]李垚垚等.一种基于TOS特征集成学习的拷贝数变异检测方法及系统, 2025.08.28,中国, 202310805614.6[P].
[3]李垚垚等.专利名称:一种基于新一代测序的拷贝数变异检测方法, 2019.03.26,中国,ZL201610114354.8[P].
软件著作权
[1]李垚垚*,张军英等.软件著作权名称:基于新一代测序的common CNV检测软件V1.0说明书,中华人民共和国,登记号:2017SR178334,2017年05月。
联系方式:20251203@xpu.edu.cn